L’Ufficio federale delle costruzioni e della logistica (UFCL) nella sua forma attuale fu creato nel 1999 in occasione di una riforma dell’Amministrazione. Il Consiglio federale divise l’allora Ufficio delle costruzioni federali e accorpò gli edifici civili situati in Svizzera e all’estero all’Ufficio centrale federale degli stampati e del materiale e a diversi stati maggiori della Confederazione. Il nuovo ufficio creato – l’UFCL – venne trasferito dal Dipartimento federale dell’interno (DFI) al Dipartimento federale delle finanze (DFF). La soprintendenza degli edifici, degli impianti e dei fondi dell’esercito passò ad armasuisse, all’interno del Dipartimento federale della difesa, della protezione della popolazione e dello sport (DDPS). Da allora il Consiglio dei politecnici federali è invece responsabile delle costruzioni dei politecnici federali di Zurigo e Losanna (ETHZ ed EPFL) e dei relativi istituti di ricerca.